#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT 300 ABRN02290675 36 . G A 36810.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-1.542;DP=996;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=28.12;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 1|1:3,993:996:99:36839,2890,0 ABRN02290675 206 . T C 15672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.664;DP=940;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:448,492:940:99:15701,0,13986 ABRN02290675 215 . T C 19006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.315;ClippingRankSum=1.869;DP=940;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL:PQ 0|1:452,488:940:99:19035,0,29873:34506.92 ABRN02290675 222 . T A 18869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.968;ClippingRankSum=-1.354;DP=940;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=20.07;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL:PQ 0|1:453,487:940:99:18898,0,29111:35057.82 ABRN02290675 235 . C A 13142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.077;ClippingRankSum=-0.718;DP=940;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL:PQ 1|0:484,456:940:99:13171,0,14314:31957.70 ABRN02290675 322 . AG A 10344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.125;ClippingRankSum=2.161;DP=940;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=2.214;QD=11.01;ReadPosRankSum=-22.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:583,357:940:99:10382,0,18903